Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HELTA6NFD8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELTA6NFD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELTA6NFD8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELTA6NFD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELTA6NFD8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELTA6NFD8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELTA6NFD8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELTA6NFD8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELTA6NFD8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELTA6NFD8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELTA6NFD8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELTA6NFD8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELTA6NFD8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HELTA6NFD8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HELTA6NFD8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HELTA6NFD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HELTA6NFD8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HELTA6NFD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms