Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
EFCAB5A4FU69 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
EFCAB5A4FU69 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
EFCAB5A4FU69 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
EFCAB5A4FU69 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
EFCAB5A4FU69 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
EFCAB5A4FU69 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
EFCAB5A4FU69 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
EFCAB5A4FU69 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
EFCAB5A4FU69 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
EFCAB5A4FU69 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
EFCAB5A4FU69 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.61■■■■■ 5.05
EFCAB5A4FU69 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
EFCAB5A4FU69 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
EFCAB5A4FU69 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
EFCAB5A4FU69 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
EFCAB5A4FU69 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.54■■■■■ 5.04
EFCAB5A4FU69 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
EFCAB5A4FU69 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
EFCAB5A4FU69 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
EFCAB5A4FU69 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
EFCAB5A4FU69 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
EFCAB5A4FU69 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
EFCAB5A4FU69 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
EFCAB5A4FU69 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
EFCAB5A4FU69 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
EFCAB5A4FU69 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
EFCAB5A4FU69 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
EFCAB5A4FU69 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
EFCAB5A4FU69 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
EFCAB5A4FU69 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
EFCAB5A4FU69 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
EFCAB5A4FU69 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
EFCAB5A4FU69 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
EFCAB5A4FU69 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
EFCAB5A4FU69 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
EFCAB5A4FU69 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
EFCAB5A4FU69 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
EFCAB5A4FU69 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
EFCAB5A4FU69 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.99■■■■■ 4.95
EFCAB5A4FU69 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
EFCAB5A4FU69 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
EFCAB5A4FU69 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
EFCAB5A4FU69 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
EFCAB5A4FU69 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
EFCAB5A4FU69 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.78■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
EFCAB5A4FU69 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
EFCAB5A4FU69 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
EFCAB5A4FU69 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
EFCAB5A4FU69 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
EFCAB5A4FU69 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
EFCAB5A4FU69 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
EFCAB5A4FU69 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
EFCAB5A4FU69 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
EFCAB5A4FU69 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
EFCAB5A4FU69 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
EFCAB5A4FU69 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
EFCAB5A4FU69 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
EFCAB5A4FU69 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
EFCAB5A4FU69 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
EFCAB5A4FU69 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
EFCAB5A4FU69 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
EFCAB5A4FU69 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
EFCAB5A4FU69 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
EFCAB5A4FU69 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.38■■■■■ 4.86
EFCAB5A4FU69 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
EFCAB5A4FU69 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
EFCAB5A4FU69 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
EFCAB5A4FU69 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
EFCAB5A4FU69 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
EFCAB5A4FU69 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
EFCAB5A4FU69 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
EFCAB5A4FU69 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
EFCAB5A4FU69 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
EFCAB5A4FU69 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
EFCAB5A4FU69 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
EFCAB5A4FU69 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.13■■■■■ 4.82
EFCAB5A4FU69 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
EFCAB5A4FU69 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
EFCAB5A4FU69 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
EFCAB5A4FU69 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
EFCAB5A4FU69 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms