Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d2A3KG59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d2A3KG59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pm20d2A3KG59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pm20d2A3KG59 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pm20d2A3KG59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pm20d2A3KG59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pm20d2A3KG59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pm20d2A3KG59 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pm20d2A3KG59 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d2A3KG59 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pm20d2A3KG59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pm20d2A3KG59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pm20d2A3KG59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pm20d2A3KG59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pm20d2A3KG59 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pm20d2A3KG59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pm20d2A3KG59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pm20d2A3KG59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pm20d2A3KG59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms