Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA9

Ajm1, Apical junction component 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ajm1A2AJA9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ajm1A2AJA9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ajm1A2AJA9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ajm1A2AJA9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ajm1A2AJA9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ajm1A2AJA9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ajm1A2AJA9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ajm1A2AJA9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ajm1A2AJA9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ajm1A2AJA9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ajm1A2AJA9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ajm1A2AJA9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ajm1A2AJA9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ajm1A2AJA9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ajm1A2AJA9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ajm1A2AJA9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ajm1A2AJA9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ajm1A2AJA9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ajm1A2AJA9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ajm1A2AJA9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ajm1A2AJA9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ajm1A2AJA9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ajm1A2AJA9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ajm1A2AJA9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ajm1A2AJA9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ajm1A2AJA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ajm1A2AJA9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ajm1A2AJA9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ajm1A2AJA9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ajm1A2AJA9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ajm1A2AJA9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ajm1A2AJA9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ajm1A2AJA9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ajm1A2AJA9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ajm1A2AJA9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ajm1A2AJA9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ajm1A2AJA9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ajm1A2AJA9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ajm1A2AJA9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ajm1A2AJA9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ajm1A2AJA9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ajm1A2AJA9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ajm1A2AJA9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ajm1A2AJA9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ajm1A2AJA9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ajm1A2AJA9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ajm1A2AJA9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ajm1A2AJA9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ajm1A2AJA9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ajm1A2AJA9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ajm1A2AJA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ajm1A2AJA9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ajm1A2AJA9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ajm1A2AJA9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ajm1A2AJA9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ajm1A2AJA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ajm1A2AJA9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ajm1A2AJA9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ajm1A2AJA9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ajm1A2AJA9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ajm1A2AJA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ajm1A2AJA9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ajm1A2AJA9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ajm1A2AJA9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ajm1A2AJA9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ajm1A2AJA9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ajm1A2AJA9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ajm1A2AJA9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ajm1A2AJA9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ajm1A2AJA9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ajm1A2AJA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ajm1A2AJA9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ajm1A2AJA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ajm1A2AJA9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ajm1A2AJA9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ajm1A2AJA9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ajm1A2AJA9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ajm1A2AJA9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ajm1A2AJA9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ajm1A2AJA9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms