Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA3A0PJX4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHISA3A0PJX4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA3A0PJX4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHISA3A0PJX4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA3A0PJX4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA3A0PJX4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA3A0PJX4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA3A0PJX4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA3A0PJX4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA3A0PJX4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA3A0PJX4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA3A0PJX4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA3A0PJX4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA3A0PJX4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA3A0PJX4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA3A0PJX4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA3A0PJX4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA3A0PJX4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA3A0PJX4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA3A0PJX4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA3A0PJX4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA3A0PJX4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA3A0PJX4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA3A0PJX4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA3A0PJX4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA3A0PJX4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA3A0PJX4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA3A0PJX4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA3A0PJX4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA3A0PJX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA3A0PJX4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA3A0PJX4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms