Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00854A0A1B0GVQ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00854A0A1B0GVQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00854A0A1B0GVQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00854A0A1B0GVQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00854A0A1B0GVQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00854A0A1B0GVQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00854A0A1B0GVQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00854A0A1B0GVQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00854A0A1B0GVQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00854A0A1B0GVQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00854A0A1B0GVQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00854A0A1B0GVQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00854A0A1B0GVQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00854A0A1B0GVQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00854A0A1B0GVQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00854A0A1B0GVQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00854A0A1B0GVQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00854A0A1B0GVQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00854A0A1B0GVQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00854A0A1B0GVQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms