Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv19A0A0B4J1H4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv19A0A0B4J1H4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv19A0A0B4J1H4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv19A0A0B4J1H4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv19A0A0B4J1H4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv19A0A0B4J1H4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv19A0A0B4J1H4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv19A0A0B4J1H4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv19A0A0B4J1H4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv19A0A0B4J1H4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv19A0A0B4J1H4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv19A0A0B4J1H4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv19A0A0B4J1H4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trbv19A0A0B4J1H4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv19A0A0B4J1H4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv19A0A0B4J1H4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trbv19A0A0B4J1H4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv19A0A0B4J1H4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv19A0A0B4J1H4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv19A0A0B4J1H4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv19A0A0B4J1H4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv19A0A0B4J1H4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv19A0A0B4J1H4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv19A0A0B4J1H4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv19A0A0B4J1H4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv19A0A0B4J1H4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv19A0A0B4J1H4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv19A0A0B4J1H4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv19A0A0B4J1H4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv19A0A0B4J1H4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv19A0A0B4J1H4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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