Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S0

Bub1b, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bub1bQ9Z1S0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bub1bQ9Z1S0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bub1bQ9Z1S0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bub1bQ9Z1S0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bub1bQ9Z1S0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bub1bQ9Z1S0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bub1bQ9Z1S0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bub1bQ9Z1S0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bub1bQ9Z1S0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms