Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rs1Q9Z1L4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rs1Q9Z1L4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rs1Q9Z1L4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rs1Q9Z1L4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rs1Q9Z1L4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rs1Q9Z1L4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rs1Q9Z1L4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms