Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
LAMC3Q9Y6N6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
LAMC3Q9Y6N6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
LAMC3Q9Y6N6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LAMC3Q9Y6N6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms