Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX5Q9Y5X3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX5Q9Y5X3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms