Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB4Q9Y5E5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB4Q9Y5E5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms