Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC42Q9Y546 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC42Q9Y546 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC42Q9Y546 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms