Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolbQ9WVP6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolbQ9WVP6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms