Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfc2Q9WUK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc2Q9WUK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc2Q9WUK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms