Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CEP164Q9UPV0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CEP164Q9UPV0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
CEP164Q9UPV0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CEP164Q9UPV0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CEP164Q9UPV0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms