Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SORCS3Q9UPU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SORCS3Q9UPU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms