Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS11EQ9UL52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11EQ9UL52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms