Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNOT11Q9UKZ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT11Q9UKZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT11Q9UKZ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms