Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR3Q9UJK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSR3Q9UJK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSR3Q9UJK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms