Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPC1L1Q9UHC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
NPC1L1Q9UHC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NPC1L1Q9UHC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NPC1L1Q9UHC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms