Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cry2Q9R194 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cry2Q9R194 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cry2Q9R194 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms