Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf346Q9R0B7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf346Q9R0B7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf346Q9R0B7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf346Q9R0B7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms