Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a4Q9QZR9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a4Q9QZR9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a4Q9QZR9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms