Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpc5Q9QX29 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc5Q9QX29 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms