Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kifc1Q9QWT9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kifc1Q9QWT9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kifc1Q9QWT9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms