Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt17Q9QWL7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt17Q9QWL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms