Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rai2Q9QVY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rai2Q9QVY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms