Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC17A6Q9P2U8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A6Q9P2U8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A6Q9P2U8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms