Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDH10Q9P2E7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDH10Q9P2E7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms