Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TVP23BQ9NYZ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TVP23BQ9NYZ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms