Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMOD3Q9NYL9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TMOD3Q9NYL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMOD3Q9NYL9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMOD3Q9NYL9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
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