Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSD3Q9NYI0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PSD3Q9NYI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD3Q9NYI0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1792.1 ms