Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C2orf42Q9NWW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf42Q9NWW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf42Q9NWW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms