Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAJC17Q9NVM6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJC17Q9NVM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms