Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED17Q9NVC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED17Q9NVC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED17Q9NVC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms