Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms