Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-22■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 219.24■□□□□ 0.676e-8■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.446e-8■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-7■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-12■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 523.38■■□□□ 1.331e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.951e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.342e-11■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-228ENST00000534352 573 ntTSL 220.77■□□□□ 0.925e-14■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-210ENST00000488338 533 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 314.97□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.915e-8■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.015e-8■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.15e-8■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.135e-8■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.325e-8■■□□□ 13.2
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 211.11□□□□□ -0.633e-7■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.814e-6■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 INPPL1-203ENST00000535985 353 ntTSL 213.12□□□□□ -0.314e-6■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 211.96□□□□□ -0.494e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-9■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 221.09■□□□□ 0.972e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.132e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 25.74□□□□□ -1.492e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-17■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 FDPS-214ENST00000489324 475 ntTSL 210.54□□□□□ -0.723e-17■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-13■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.451e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.671e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 TXN-203ENST00000487892 540 ntTSL 23.76□□□□□ -1.811e-8■■□□□ 13.1
APOBEC3CQ9NRW3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-21■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 312.85□□□□□ -0.351e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.3□□□□□ -0.61e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.781e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 28.45□□□□□ -1.061e-9■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.913e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.693e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 23.15□□□□□ -1.913e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.393e-7■■□□□ 13
APOBEC3CQ9NRW3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.971e-12■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 222.46■■□□□ 1.192e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.082e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.971e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 220.32■□□□□ 0.842e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MPC2-203ENST00000458574 645 ntTSL 520.19■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 412.8□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPM-210ENST00000598367 298 ntTSL 511.21□□□□□ -0.612e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.82e-9■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-203ENST00000517480 684 ntTSL 58.53□□□□□ -1.041e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-207ENST00000524244 434 ntTSL 27.83□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 23.87□□□□□ -1.791e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.167e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.937e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-202ENST00000412343 778 ntTSL 323.75■■□□□ 1.394e-10■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.127e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 222.02■■□□□ 1.124e-10■■□□□ 12.9
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 91.7 ms