Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAPOLBQ9NRJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms