Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPRD1BQ9NQG5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPRD1BQ9NQG5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms