Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1B3Q9NPD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms