Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX2Q9NPC8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX2Q9NPC8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX2Q9NPC8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms