Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MID1IP1Q9NPA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MID1IP1Q9NPA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MID1IP1Q9NPA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms