Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep4Q9JM96 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep4Q9JM96 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms