Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Rabgef1Q9JM13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rabgef1Q9JM13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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