Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1aQ9JLR9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1aQ9JLR9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Higd1aQ9JLR9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms