Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col5a3Q9JLI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col5a3Q9JLI2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col5a3Q9JLI2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col5a3Q9JLI2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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