Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod4Q9JLH8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod4Q9JLH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod4Q9JLH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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