Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmgn5Q9JL35 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgn5Q9JL35 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms