Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1aQ9JKU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmx1aQ9JKU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmx1aQ9JKU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmx1aQ9JKU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms